环磷酰胺等免疫抑制剂不仅有免疫抑制作用，同时还有较强的抗炎作用。所以在自身免疫病的治疗不仅能起到巩固疗效的作用，还可起到消除症状的作用。

　　然而，环磷酰胺的这种抑制作用也决定了它的毒副作用：

　　骨髓抑制引起贫血，造成白细胞、红细胞减少。特别是可以造成严重的血小板减少，可以引起严重的大出血，应特别引起注意。

　　易感染是环磷酰胺的主要副作用，这可能与粒细胞减少有关。在应用环磷酰胺时常常应用抗生素以预防和控制感染，这又增加了红斑狼疮不稳定的因素。

　　长期应用环磷酰胺将不可避免的出现性腺抑制，造成女性患者月经紊乱或闭经，会影响青年女性将来的结婚和生育。对于处于生长发育期的少年儿童将会影响生长发育。

　　远期的致癌作用和致畸胎作用。

　　因为环磷酰胺有严重的毒副作用，应该慎重选择应用环磷酰胺的适应症。对生长发育和生育的影响，将会影响患者的生活质量造成深远的影响。在今天的医疗水平，已经远远不是如何保护患者的生命问题，而是如何提高患者的生活质量。笔者认为只有在具有生命危险的红斑狼疮患者才有必要应用环磷酰胺的免疫抑制剂。在处在生长发育期的儿童尤其应避免长期应用。