血清中ALT异常是HCV感染者最先出现的体征，但不是诊断丙型肝炎的必需条件。用于HCV感染诊断的检测方法见表。
表 HCV感染的实验室诊断方法及应用
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方法 筛选 确诊 治疗应答的评估 治疗应答和疗程的预测 |
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ALT × × |
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EIA × |
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RIBA × |
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HCV RNA定性检测 × × |
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HCV RNA定量检测 × × |
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基因分型 × |
• 免疫测定(EIA)
–用于对高危人群的筛选和初步诊断。
•重组免疫印迹分析(RIBA)
–对无症状患者、供血者或低危险人群的假阳性结果进行分析，(Gretch, 1997)。
•分子生物学方法，如AMPLICOR ® HCV Test, v2.0
– 确诊以下患者的HCV感染：
▲EIA检测阳性，但RIBA不能确诊的患者。
▲疑为急性HCV感染，但EIA检测阴性的患者。
▲原因不明的肝炎患者。
▲怀疑抗体检测结果为假阴性的患者。
–慢性丙型肝炎患者病毒血症的确定。
肝脏组织活检也是丙型肝炎的确诊、评价疾病的严重程度（炎症坏死和肝纤维化）、评价治疗的效果以及发现可能的伴随疾病的有用方法（Brunt, 2000）。肝组织活检还有助于与其它疾病，如酒精性肝病等相鉴别，并对丙型肝炎进行治疗前分期。（Perrillo, 1997; Saadeh et al. 2001）。
在HCV RNA检测方法应用之前，ALT检测是治疗的应答的监测指标。然而生化学应答即ALT水平恢复正常并不能一直与病毒学应答即血清HCV RNA转阴相符合（Marcellin et al. 2001），因此，现在认为HCV RNA水平是监测患者对聚乙二醇化α-干扰素治疗应答的主要指标。
AMPLICOR HCV MONITOR™ （ Version 2.0）是用于病毒负荷的定量、监测患者对治疗应答的产业化标准试剂盒。用此试剂检测丙型肝炎患者基线血清标本或未治疗患者的血清标本时，这些标本的HCV RNA水平可能超出线性检测范围的上限即800,000IU/mL或2,000,000拷贝/mL，需对标本稀释100倍（AMPLICOR HCV标准检测试剂盒操作步骤）。丙型肝炎抗病毒治疗的疗程和预后均与治疗前HCV RNA水平有关。