目前临床所用的胃癌标志物特异性不强，目前主要应用的有以下几种：
1、CEA CEA存在于胚胎胃肠粘膜上皮细胞与一些恶性肿瘤细胞表面，是一种糖蛋白。虽然约有40%-70%的胃癌患者血清CEA水平高于正常值，但CEA升高也可见于结肠癌、胃癌、胰腺癌、乳腺癌、肺癌、甲状腺髓样癌及某些非癌疾病。因此，CEA诊断胃癌的特异性不高。可用于分析疗效，判断复发和转移。
2、CA199 CA199是一种高分子量糖蛋白。在多种腺癌中血清CA199水平升高。对胰腺癌、胃肠癌及肝胆管癌敏感性高。其检测胃癌的阳性率约42.7%-50%，与CEA联合检测时阳性率达70%，可以提高胃癌诊断的敏感性和特异性。可作为恶性肿瘤预后判断和疗效评估的指标。
3、CA50 CA50与CA199相似，可用于监测进展期的胃肠癌和胰腺癌，但特异性较CAl99差。
4、CA724 CA724是高分子量的类粘蛋白分子。可用于诊断及监测胃癌。
5、CAl95 CAl95是一种糖蛋白或粘蛋白。在胃肠癌和胰腺癌患者的血清中CAl95水平升高，因此可以作为胃癌的血清肿瘤标志。
6、CA242 CA242为一种粘蛋白。CA242在正常胰腺、结肠粘膜中存在，但表达水平低；在胰腺癌、结肠癌、直肠癌和胃癌中表达水平高。CA242辅助诊断胃癌的敏感性与CEA和CAl99相近。
7、CYFRA2H CYFRA2H是一种细胞角蛋白，是正常细胞及恶性上皮细胞的支架蛋白。当胃癌发生腹腔转移、肝转移等情况时，血清CYFRA2H水平升高。所以，CYFRA2H可以作为胃癌进展或复发的血清标志物。