肝性脑病的治疗无特异性方法，仍以综合治疗为主。
一、消除与抑制肠道毒性物质的产生与吸收
1．限制蛋白质摄入：肝性脑病一经诊断立即暂停蛋白质的摄入、静滴高渗葡萄糖及小剂量胰岛素（每日供能量6694～8368J）以降低体内蛋白质分解。待智力功能趋于正常并保持稳定,增加蛋白质饮食每日0.5～1.0g/kg，以后每10d增加10g，直至每天40～60g而不诱发肝性脑病为止。
2．改变肠内环境，减少氨的吸收：应用乳果糖除能降低血氨外,还可减少内毒素血症及其它毒性物质，口服法30ml（60%）3次/d，灌肠法用1:10 乳果糖糖浆300ml加水700ml在20～30min灌入，必要时重复或每天3次，乳梨醇为近年新开发的第三代乳果糖制剂，起效比乳果糖早，疗效、适应证与乳果糖相仿。
3．抑制肠内细菌,减少氨产生：新霉素2～4g/d经胃管注入,口服或灌肠。二糖酶抑制剂AO-128是链霉菌属的提取物，为二糖酶特异性抑制剂，口服后可以抑制肠道二糖酶。用药后肠道碳水化合物降解减少，而达到抑制肠内细菌。
4．清洁灌肠，清除肠内蛋白质或贮存血液：口服或鼻饲50%硫酸镁30-60ml或用米醋、乳果糖高位灌肠使肠内pH值控制在5-6以下，有利于NH3通过粘膜进入肠腔，最后形成NH4排出体外。
二、脱氨药物的应用
在患者内环境偏于酸中毒时可用乙酰胺，剂量为1g静滴或静注（OA）可以促进体内的氨转化和尿素合成，减低慢性肝病时血氨水平。
三、纠正氨基酸比例失调
给患者应用支链氨基酸使支氨基酸与芳香氨基酸的比例正常起到治疗作用。国内常用的制剂为14A-800，肝安、六合氨基酸及支链氨基酸。
1．旋多巴：左旋多巴是正常神经递质多巴胺的前体，它通过血脑屏障进入脑组织，经酶促作用产生多巴胺和去甲基肾上腺素，从而取代假神经递质使神经功能恢复正常。剂量为0.2-0.6g/d静肪点滴，也可分2-4次口服剂量为2-6g/d，本药不宜与维生素B6同用，因B6有多巴脱羧酶的作用，它也不宜与单胺氧化酶抑制如麻黄碱同用，以免发生血压骤然升高。
2．隐亭：为多巴胺受体激动剂，本药对应用新霉素和乳果糖治疗无效的慢性肝脑病患者有较好的疗效。用量为：开始口服2.5g/d，每3d递增2.5g/d，达到15 g/d时维持剂量。最好同时给乳果糖40ml/d，限制蛋白质摄入量。
3．γ-氨基丁酸：是中枢神经系统主要抑制性神经递质。贮存于突触前神经无囊泡内，无生物活性，与突触后神经元膜面的特异性受体结合后，抑制结合后，抑制中枢神经传导。苯二氮卓是突触后膜受体的配体之一。近年静脉应用苯二氮卓的拮抗剂氟马西尼治疗HE患者，临床症状缓解率（15%）明显高于安慰剂治疗的对照组（3%），且对症状较重的患者易于起效，静脉给药患者耐受良好。
五、根除幽门螺杆菌（HP）治疗
HE患者是否需要根除HP治疗仍有争议。HP感染与肝硬化无关，但可使患者血氨升高，促进HE的发生和发展。
六、肝移植
对于预防后差或病情恶化的重肝患者，应考虑进行肝移植。
七、高压氧疗法
高压氧治疗可增加血氧含量，促进肝细胞再生，加速代谢功能恢复，提高存活率，吸纯氧，每次2.5h，每天1次，15d为1疗程。
八、人工肝治疗
本疗法适用于急性肝性脑病患者，不但可减少患者血浆中的有害物质，而且还能补充一些正常人血浆中所含有的有益物质，特别是用新鲜血浆作为置换液，不但可补充蛋白质，而且可补充凝血因子、免疫因子，患者的存活率也大为提高。
用聚丙烯腈膜进行透析，则可清除分子量5×105~5×106的物质，如氨、游离脂肪酸、胆汁酸等，且对芳香氨基酸的清除也有较好的作用；血液透析还能纠正暴发性肝功能衰竭患者常见的水电解质紊乱和酸碱平衡失调，对并发肾功能衰竭患者更合适。
血液灌流：活性炭是一种多孔吸附剂，可吸附多种物质，故对清除肝性脑病患者血液中的毒性物质有较好的作用。但活性炭又可吸附白细胞、血小板而造成溶血，并可引起肺栓塞，故必须用一种“人工细胞”将其包裹起来。这种“人工细胞”为实验室制备的一种微囊，大小与生物细胞相似，有很好的生物相容性，血液中的毒性物质可透过人工细胞的薄膜进入人工细胞而被活性炭吸附。
九、去除诱因，维持水电解质和酸碱平衡
上消化道出血、急性感染、低钾性碱中毒、水和电解质紊乱等是HE的重要诱因和常见并发症，治疗过程中须仔细寻找，并及时处理和预防HE患者常见低钾、低氯性碱中毒，而低钙、低镁血症也不少见。HE终末期则以高钾血症、代谢性酸中毒及稀释性低钠血症多见。临床上需严格参照患者尿量，适量补充钾离子，并同时补镁（常用门冬氨酸钾镁或硫酸镁），补充钙离子常用葡萄糖酸钙或谷氨酸钙。稀释性低钠血症的处理，以限制水入量为主，多用渗透性利尿剂如甘露醇，排水多于排钠。高钾血症及代谢性酸中毒品走私案多见于肾功能衰竭的少尿或无尿患者，行血液透析治疗，效果明显。
十、抗病毒治疗
肝炎病毒与HE发病机制并无直接关系，抗病毒治疗在于积极治疗HE的原发病，主要适宜于肝炎病毒感染所致暴发性肝功能衰竭的早期患者。临床用药种类较多，干扰素和拉米夫定是目前公认的疗效较好且作用稳定的药物。
十一、介入治疗
脾肾或胃肾等侧支循环与偶发性HE或慢性复发性HE发病有关。应用介入技术封闭分流的血管，能降低HE的复发率，且不增加曲张静脉出血的危险性。